구글 딥마인드의 스핀오프 기업인 아이소모픽 랩스는 2026년 2월 현재 공개된 AI 기반 약물 설계 시스템 중 가장 앞선 것으로 평가받는 IsoDDE를 발표했습니다.
이 플랫폼은 AlphaFold 3의 구조 예측 중심에서 벗어나 디지털 신약 개발 워크플로우의 오랜 한계를 해결하는 것을 목표로 하는 완전한 사이클의 컴퓨터 시뮬레이션 엔진으로 자리매김하고 있습니다.
회사에 따르면 IsoDDE는 익숙하지 않은 생물학적 시스템에도 적용 가능하고, 기존의 물리 기반 시뮬레이션에 의존하지 않고 결합 친화도를 예측하며, 숨겨진 조절 부위를 식별하고, 항체 및 기타 복잡한 생체 분자와 효과적으로 작동하도록 설계되었습니다.
아이소모픽 랩스는 자체 개발 프로그램에서 IsoDDE가 이미 이전에 특성이 규명되지 않은 구조를 해석하고, 실험적으로 주석이 달리지 않았던 포켓을 탐지하며, 약물 개발이 어려운 표적에 대한 새로운 화학 물질을 생성하는 데 사용되고 있다고 밝혔습니다. 이 시스템은 구조 예측과 실제 약물 설계 작업 사이의 간극을 메우기 위한 통합 컴퓨팅 프레임워크로 제시되며, 아이소모픽 랩스는 기존의 딥러닝 및 물리 기반 접근 방식보다 높은 정확도를 제공한다고 주장합니다.
이 플랫폼 개발은 2024년 AlphaFold 3 출시 이후 AI 기반 분자 모델링 분야의 급속한 발전에 발맞춰 이루어졌습니다. AlphaFold 3는 단백질-리간드 구조 예측 분야에서 상당한 발전을 이루었지만, 다양한 생화학적 특성을 처리하고 학습 데이터 범위를 벗어난 시스템에도 적용해야 하는 실제 신약 개발 파이프라인에 계산 방법을 적용하는 데에는 한계가 있었습니다. IsoDDE는 이러한 격차를 해소하고 생물학적 및 화학적 공간의 미개척 영역을 탐색할 수 있는 확장 가능한 기반을 제공함으로써 그 역할을 수행하고자 합니다.
아이소모픽 랩스는 IsoDDE 플랫폼이 이미 주요 제약 회사들과의 협력에 통합되어 있으며, 파트너사들이 실험적 검증 및 임상 개발을 진행하는 동안 플랫폼이 컴퓨터 시뮬레이션을 통한 설계 및 예측을 수행한다고 밝혔습니다. 또한, 회사는 자체 파이프라인을 지속적으로 확장해 왔습니다. 2025년에서 2026년 사이에 상당한 투자를 유치했는데, 특히 2025년 3월에는 6억 달러 규모의 투자를 확보했습니다. 아이소모픽 랩스는 주로 항암 분야에서 여러 자체 개발 분자들을 임상 시험에 진입시키기 위해 준비하고 있습니다.
IsoDDE는 예측 정확도를 향상시키고, 약물 표적의 범위를 넓히며, 분자 모델링에서 실험적으로 검증된 치료 후보 물질로의 전환을 가속화하기 위해 고안된 차세대 계산 엔진으로 소개됩니다.
IsoDDE, AI 기반 신약 설계에 새로운 기준점 제시
IsoDDE는 예측 정확도와 기능 범위 면에서 상당한 진전을 이룬 것으로 평가되며, 인간 생물학을 지배하는 분자 시스템에 대한 보다 자세한 시각을 제공하고 이러한 시스템에 영향을 미치도록 설계된 화합물의 전산 설계를 개선합니다.
아이소모픽 랩에서 진행 중인 연구 프로그램에서 이 플랫폼은 이전에 특성화되지 않은 구조를 해석하고, 실험적으로 확인되지 않은 영역을 탐지하며, 까다로운 치료 목표를 겨냥한 새로운 화학 물질을 생성하는 데 일상적으로 사용되는 것으로 알려져 있습니다.
회사 측은 가상 약물 설계의 범위를 확장하는 방향으로 개발을 지속할 것이며, 이러한 향상된 기능을 기존에 난제로 여겨졌던 신약 개발 분야에 적용할 계획이라고 밝혔습니다.
Isomorphic Labs의 차세대 IsoDDE 엔진이 복잡하고 표적화하기 어려운 분자의 AI 기반 설계를 발전시킨다는 게시물이 Metaverse Post 에 처음으로 게재되었습니다.
